一、合同双方的权利义务要明确
由于网站建设项目包括多方面的工作以及网站建设完成之后的后期维护工作，所以合同需要确定哪些是承建方的义务、哪些是委托方的义务，以及双方要求对方提供哪些相应的协助的权利。而且对于双方各自的义务部分，必须相当明确地作出说明，以免在履行合同时产生不必要的纠纷。
二、网站建设的完成如需要合作完成时，则需对合作的相关内容作出约定
如果承建方在工作中需要和委托方或者第三方进行合作，就必须清晰说明这种合作的流程，方式和要求。
三、项目建设工作流程与时间进度需作出说明
1、合同必须说明项目开展的工作流程。对于每个工作流程，需要概要说明承建方的工作内容，尤其对于需要企业参与的部分，需要说明企业的工作内容和要求。例如，调研时需要企业的配合和资源提供等设计制作确认时的确认方式和确认范围等。
2、对每个流程环节的完成时间要说明。合同需要给出每个流程环节的工作估计以及项目最终完工的日期估计，双方可以根据需要，协商在进度限制上的严格度。
四、网站建设的质量要求尽量具体细化
1、网站建设质量主要指网站页面设计，制作与网站程序的质量。合同需要对这些工作的质量作出周到的、尽量可度量的要求，譬如为保证浏览速度，建设方也可以对每个网页的大小作出一般性限制。对于页面设计与制作，由于对设计风格的认识差异会导致建设方和承建方的质量评判结果不同，同时设计质量也难以度量，容易出现建设方多次否定设计的情况。在这个时候需要用变通的办法来弥合双方的质量评判差异。例如，可以由承建方设计出几种建设方要求风格的设计页面，然后由建设方选择，或者重复修正设计不能超过几次，而承建方可以以半价收取落选设计页面费用的代价来限制设计要求的变化。
2、对于网站功能性程序来说，合同应该对功能作出详细的说明。如会员注册登陆系统，那么除了会员的注册，登陆，退出外，系统还应该提供给会员什么功能，譬如新闻定制等。
五、制订出合适的网站承建费用支付标准和支付方式
1、支付标准网站建设业内一般采用按制作量记费的方式，譬如按页面数量记费。但网站制作量，如页面数量等，在制作过程中是变化的，所以在签合同的时候无法给出整个网站建设完成后的确切费用。但是合同却可以给出网站建设的收费项和收费标准，等网站建设完成后，统计整个网站的每项工作量，再结合记费标准来算出项目实际标的。这一条款关系到日后合同标的的计算，所以请务必约定清楚。双方不妨多花一点时间来协商这里的细节，以达到彼此在这一条款上的一致认可，以防日后引起不必要的争执。
2、支付方式费用支付一般可以分成三次进行。一般合同签署一周内支付一定数量，作为项目启动费用项目中期支付一定数量项目结束后，计算项目实际标的，再支付余额。最好不要在合同签订之后网站还没建设完成之前一次性支付所有款项，以免在网站建设不符合合同约定时，加大建设方追究承建方的责任的困难。至于最终如何支付，可由双方协商一致来约定。
